| 壹、 |
修業年限：一至四年。 |
| 貳、 |
研究生之論文指導教授中應至少有一位為本所專任、合聘或兼任教師。（詳見本所『教師指導研究生原則』，自92學年度入學之新生開始實施）。 |
| 參、 |
畢業學分：合計為 24 學分（含必修學分 12 學分）
必修學分
B44 M0010 碩士論文，0學分
研究生於預計可畢業之學期修習，並於該學期提出學位考試申請，始得參加學位考試。
B44 M0020 碩士班專題討論，1學分，共須修3學分
得以本所專業科目專題討論充抵，最多充抵一學分。
B44 M0030 專題研究，1學分，共須修4學分
實施方式由各老師決定。
B44 M0040 碩士班論文專題報告，1學分
研究生於預計可畢業之學期修習。實施方式詳見本所『「碩士班論文專題報告」課程實施辦法』。
B01 U0100
「動物學實驗教學實習」，3學分或B01
U0120「植物學實驗教學實習」，3學分（含上課一學期及擔任實習助教一學期）
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共須修3學分，所有研究所新生均應接受「動物學實驗教學實習」或「植物學實驗教學實習」教學訓練（二選一），修習本課程時須同時擔任實習助教，學期成績由教學訓練及擔任實習助教時之表現評定。
具教師資格或公務人員任用資格之在職進修生（附單位同意函），得依在職進修證明申請免修本課程。外籍生得申請免修本課程。免修本課程者須以選修課程補足3學分，以符合畢業最低學分之規定
B00 U0100_研究生入門：科學之路，1學分
101學年度起為本所新生必修課程。外籍生、僑生或陸生得免修。
生態學，0學分
自94學年度起「生態學」為本所必修課程。於大學時已經修過本課程，得申請免修。97學年度起碩士招生考試入學者得免修「生態學」。
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| 肆、 |
碩士班研究生於大學部時所修習之生物學相關研究所課程（超過其大學畢業學分部份），成績達研究生及格標準者，經指導教授同意後，由本所研究生委員會審核通過者，准予抵免（最多十二學分）。 |
| 伍、 |
碩士班研究生修業一年以上，成績優異，得依本校及本所相關規定，申請逕行修讀本所博士班（詳見本所『碩士班肄業研究生逕行修讀博士學位審查辦法』）。 |
| 陸、 |
研究生獎勵金：辦法詳見『臺灣大學生態學與演化生物學研究所獎勵金發放施行細則』。 |
| 柒、 |
學位考試： 一、
申請資格：修畢符合本所規定之學分，得經指導教授之同意，向「研究生委員會」提出學位考試申請。
二、 申請日期：每年十一月三十日(第一學期)或四月三十日(第二學期)前應提出學位考試申請。
三、
研究生於申請學位考試後，若因故無法於該學期舉行學位考試，應於學校行事曆規定學期結束日之前辦理考試撤銷申請。逾期未撤銷亦未舉行考試者，以一次不及格論。
四、
論文最後定稿之繳交期限，第一學期為一月三十一日，第二學期為七月三十一日。逾期而未繳交者，次學期仍應註冊，並於補交論文後，屬該學期畢業。 |
| 捌、 |
本規定未盡事宜，均依本校教務章則相關辦法辦理。 |
| 玖、 |
本辦法經所務會議通過後實施，修正時亦同。 |
